GRID and computational chemistry
Keywords:
Abstract
At the Institute of Problems of Chemical Physics (Russian Academy of Sciences), it is developed and now is maintained the GRID resource center, including several sites on the basis of middleware gLite and Unicore. Some applied program interfaces of various levels are developed to start the operation of single-processor and parallel applications in the distributed computing environment in the area of computing chemistry. A method for the preparation of a wide class of computing chemistry tasks, including a technique of preparation and formation of parallel «bunches» of problems, their start on the distributed resources and subsequent «assemblage» of results is realized. User WWW interfaces for multiparameter tasks and for the GAMESS quantum-chemical package are realized inside the GECP Web portal (grid.icp.ac.ru, Grid Enabled Chemical Physics). The paper was prepared on the basis of the author’s report at the International Conference on Parallel Computing Technologies (PaVT-2009; http://agora.guru.ru/pavt).
Downloads
Published
Issue
Section
References
- Волохов В.М., Варламов Д.А., Пивушков А.В. Крупномасштабные задачи химии на параллельных и распределенных вычислительных полигонах: современное состояние и перспективы // «Научный сервис в сети Интернет: решение больших задач». Труды Всероссийской научной конференции. Новороссийск. М.: Изд-во Моск. ун-та, 2008. 210-212.
- Алдошин С.М., Варламов Д.А., Волохов В.М., Покатович Г.А., Сурков Н.Ф., Станиловский А.И. GRID и вычислительная химия в ИПХФ РАН // «Научный сервис в сети Интернет: технологии параллельного программирования». Труды Всероссийской научной конференции. Новороссийск. М.: Изд-во Моск. ун-та, 2006. 91-93.
- Варламов Д.А., Волохов В.М., Пивушков А.В., Сурков Н.Ф., Покатович Г.А. Распределенные и параллельные вычисления в области химии на ресурсном узле ГРИД ИПХФ РАН // The Third Int. Conf. on Distributed Computing and GRID Technologies in Science and Education. Дубна: Изд-во ОИЯИ, 2008. 120-122.
- Алдошин С.М., Волохов В.М., Варламов Д.А., Пивушков А.В. Вычислительная химия в среде GRID: параллельные и распределенные вычисления // Труды Второй международной конференции «Суперкомпьютерные системы и их применение SSA’2008». Минск: ОИПИ НАН Беларуси, 2008. 114-118.
- Волохов В.М., Алдошин С.М., Варламов Д.А., Пивушков А.В. Использование GRID технологий для исследования структуры и свойств наноматериалов // Distributed Computing and Grid-Technologies in Science and Education. Extended Proceedings of the 3rd Intern. Conf. Дубна: Изд-во ОИЯИ, 2008. 131-136.
- Варламов Д.А., Волохов В.М., Покатович Г.А., Сурков Н.Ф., Пивушков А.В. Российский сегмент GRID в области вычислительной химии // «Распределенные вычисления и Грид-технологии в науке и образовании». Труды второй международной конференции. Дубна: Изд-во ОИЯИ, 2006. 243-254.
